Au-delà des effets de l’infection par le VIH et des inhibiteurs de l’intégrase

Aug 24, 2023

Rapports scientifiques volume 13, Numéro d'article : 14327 (2023) Citer cet article

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Le microbiome oral est la deuxième plus grande communauté microbienne chez l’homme après l’intestin. L'infection par le virus de l'immunodéficience humaine (VIH) déclenche une déficience du système immunitaire qui pourrait favoriser la croissance et la colonisation d'agents pathogènes dans la cavité buccale, et cette dysbiose a été associée à des manifestations buccales qui aggravent la qualité de vie de ces patients. La thérapie antirétrovirale (TAR) pourrait également entraîner des changements dans des taxons bactériens oraux spécifiques associés à de telles maladies parodontales. Les inhibiteurs de transfert de brin de l'intégrase (INSTI), thérapie de choix dans le traitement des patients naïfs atteints du VIH, sont capables d'inverser l'impact de l'infection par le VIH sur l'inflammation systémique, la perméabilité intestinale et la diversité/richesse bactérienne intestinale. L'objectif de cette étude était d'analyser les effets de l'infection par le VIH en soi et des INSTI sur la composition des bactériomes salivaires, en tenant compte d'autres facteurs tels que le tabagisme, qui pourraient également avoir un impact significatif sur le microbiome buccal. Pour atteindre cet objectif, 26 volontaires non infectés par le VIH et 30 patients infectés par le VIH (15 naïfs et 15 sous régime INSTI) ont été recrutés. Des échantillons salivaires ont été collectés pour mesurer les niveaux de lysozyme. La composition du bactériome oral a été analysée par séquençage du gène de l'ARNr 16S. Les patients naïfs infectés par le VIH présentaient des taux de lysozyme statistiquement plus élevés que les témoins (p < 0,001) et les patients traités par INSTI (p < 0,05). Notre étude n'a pas pu détecter de différences dans la diversité α ou β entre les trois groupes analysés, bien que des différences significatives dans l'abondance de certains ordres taxonomiques bactériens aient été détectées (abondance plus élevée dans le phylum Pseudomonadota, dans l'ordre Acholeplasmatales et dans les genres Ezakiella). et Acholeplasma dans le groupe naïf par rapport aux témoins ; et une abondance plus élevée dans le phylum Mycoplasmatota, dans l'ordre des Acholeplasmatales, et dans les genres Acholeplasma et la bactérie Eubacteriaceae non cultivée chez les patients infectés par le VIH traités par INTI par rapport aux témoins). Ces différences semblent partiellement indépendantes de l’habitude de fumer. L’infection par le VIH et les effets des INSTI sur le microbiote buccal ne semblent pas très puissants, probablement en raison de la modulation d’autres facteurs tels que le tabagisme et la plus grande exposition extérieure de la cavité buccale.

L'infection par le VIH déclenche une déficience du système immunitaire qui pourrait favoriser la croissance et la colonisation d'agents pathogènes dans la cavité buccale. En fait, cette dysbiose a été associée à des manifestations buccales telles que la candidose oropharyngée1,2,3. En outre, le traitement antirétroviral (TAR) lui-même peut augmenter la translocation microbienne orale en raison de l'inhibition de la réparation et de la prolifération des cellules épithéliales4, 5. Le VIH et le TAR entraînent des modifications de taxons bactériens spécifiques dans le microbiome oral associés à la maladie parodontale6. En fait, il a été récemment rapporté que les modifications du microbiome buccal après le début du TAR sont complexes et pourraient jouer un rôle important dans la fonction immunitaire et les maladies inflammatoires6. L’analyse du microbiote oral à partir d’échantillons de plaque supra et sous-gingivale prend souvent du temps7, 8. Pour cette raison, l’analyse basée sur la salive a attiré une attention considérable car elle est simple, non invasive et peu coûteuse9,10,11.

Des travaux antérieurs de notre groupe ont démontré que les TAR basés sur les inhibiteurs de transfert de brin de l'intégrase (INSTI) étaient associés à des niveaux d'inflammation systémique, de translocation bactérienne et de diversité microbienne similaires à ceux observés chez les témoins non infectés12. En outre, ces études ont montré un impact évident de l’infection par le VIH et des traitements à base d’INSTI sur le bactériome intestinal13 et le virome14. Cependant, la manière dont les TAR à long terme, et plus particulièrement les INSTI, modulent le microbiote oral chez les patients infectés par le VIH et les implications de ces effets sur la santé méritent des recherches plus approfondies. Ainsi, l'objectif de ce travail était d'analyser les effets de l'infection par le VIH et des thérapies à base d'INSTI en première intention sur la composition des bactériomes salivaires. En outre, voyant que certaines habitudes telles que le tabagisme pourraient altérer le microbiote oral15, nous avons également étudié l'impact du tabagisme sur la composition du microbiote oral de patients infectés par le VIH avec et sans traitements à base d'INSTI.